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ChIP

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ChIP

  • 所属分类:表观组学技术

  • 点击次数:
  • 发布日期:2018/11/20
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详细介绍

真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在。因此,研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。染色质免疫共沉淀技术(Chromatin immunoprecipitation assay, ChIP)是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。

 

技术原理

它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。ChIP不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用,还可以用来研究各种组蛋白共价修饰与基因表达的关系。

 

技术流程

表观组学技术服务 

 

技术应用

Ø 被特定靶蛋白占据的DNA序列

Ø 在指定的细胞条件下,特定蛋白质(如转录因子)在整个基因组上的结合位点和分布

Ø 基因转录和聚合酶活性

Ø 与疾病表型相关的复杂的DNA/蛋白质相互作用

Ø 蛋白质(如组蛋白)的修饰,这可能影响染色质结构和基因表达

Ø 核小体结构和染色体维持的调控

Ø 等位基因的特异性结合检测

 

样品要求

l 信息:目的基因、转录因子的背景资料;

l 样本:

1. 植物组织/真菌菌丝,2~5g

2. 动物组织,,0.5~2g

3. 细胞系/细菌菌液,取10^6-10^7个做甲醛交联

l 抗体:进口IP级别抗体/非商业化标准抗体(需检测),或者由爱基生物提供;

l 样品运输:所有样本液氮速冻之后,选择干冰运输。建议用灭菌的样品袋或LoBind 管,parafilm将管口密封好。

 

结果展示

基因表达定量 


本文网址:/product/572.html

关键词:表观组学技术服务,基因表达定量,基因表达调控

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